Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkchP23298 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkchP23298 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkchP23298 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkchP23298 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkchP23298 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkchP23298 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkchP23298 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkchP23298 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PrkchP23298 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkchP23298 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkchP23298 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkchP23298 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkchP23298 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkchP23298 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms