Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja1P23242 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gja1P23242 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja1P23242 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gja1P23242 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja1P23242 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja1P23242 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja1P23242 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms