Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36P22893 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp36P22893 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms