Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ntf3P20181 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ntf3P20181 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ntf3P20181 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms