Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifrd1P19182 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd1P19182 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd1P19182 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms