Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnnc1P19123 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnc1P19123 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnc1P19123 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms