Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18530 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18530 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18530 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18530 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18530 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18530 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18530 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18530 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18530 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18530 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18530 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18530 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18530 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18530 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18530 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18530 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18530 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18530 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18530 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18530 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18530 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18530 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18530 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18530 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P18530 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P18530 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18530 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P18530 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18530 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18530 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18530 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18530 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18530 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18530 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18530 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18530 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18530 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18530 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18530 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18530 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18530 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18530 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18530 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18530 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P18530 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18530 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18530 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18530 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18530 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18530 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18530 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18530 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18530 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18530 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18530 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18530 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18530 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18530 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18530 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18530 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18530 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18530 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18530 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18530 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18530 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P18530 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18530 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18530 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18530 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18530 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18530 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18530 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18530 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18530 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18530 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18530 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18530 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18530 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P18530 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P18530 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18530 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18530 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18530 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18530 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18530 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms