Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcnaP17918 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcnaP17918 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PcnaP17918 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcnaP17918 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcnaP17918 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcnaP17918 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms