Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp53P15975 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp53P15975 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp53P15975 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp53P15975 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp53P15975 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp53P15975 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp53P15975 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp53P15975 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp53P15975 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp53P15975 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp53P15975 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp53P15975 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp53P15975 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp53P15975 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp53P15975 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms