Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd44P15379 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd44P15379 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd44P15379 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd44P15379 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd44P15379 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd44P15379 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd44P15379 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd44P15379 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms