Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrphP15331 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrphP15331 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrphP15331 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrphP15331 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrphP15331 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrphP15331 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrphP15331 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrphP15331 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrphP15331 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrphP15331 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrphP15331 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrphP15331 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrphP15331 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrphP15331 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrphP15331 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrphP15331 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrphP15331 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrphP15331 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PrphP15331 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrphP15331 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrphP15331 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrphP15331 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrphP15331 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrphP15331 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrphP15331 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrphP15331 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrphP15331 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrphP15331 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrphP15331 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrphP15331 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrphP15331 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrphP15331 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrphP15331 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrphP15331 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PrphP15331 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PrphP15331 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrphP15331 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrphP15331 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrphP15331 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrphP15331 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrphP15331 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PrphP15331 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrphP15331 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrphP15331 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrphP15331 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrphP15331 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrphP15331 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrphP15331 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrphP15331 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrphP15331 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PrphP15331 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrphP15331 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrphP15331 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PrphP15331 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrphP15331 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrphP15331 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrphP15331 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrphP15331 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrphP15331 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrphP15331 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrphP15331 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrphP15331 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrphP15331 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrphP15331 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrphP15331 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrphP15331 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrphP15331 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrphP15331 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrphP15331 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrphP15331 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrphP15331 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrphP15331 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrphP15331 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrphP15331 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrphP15331 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrphP15331 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrphP15331 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrphP15331 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PrphP15331 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrphP15331 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrphP15331 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrphP15331 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrphP15331 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PrphP15331 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrphP15331 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrphP15331 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrphP15331 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrphP15331 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrphP15331 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrphP15331 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrphP15331 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrphP15331 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PrphP15331 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrphP15331 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrphP15331 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrphP15331 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrphP15331 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrphP15331 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrphP15331 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms