Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

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Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DmdP11531 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DmdP11531 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DmdP11531 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmdP11531 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmdP11531 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmdP11531 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DmdP11531 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmdP11531 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmdP11531 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmdP11531 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmdP11531 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DmdP11531 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmdP11531 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmdP11531 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmdP11531 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmdP11531 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmdP11531 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmdP11531 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmdP11531 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmdP11531 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmdP11531 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmdP11531 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DmdP11531 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DmdP11531 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DmdP11531 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DmdP11531 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DmdP11531 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DmdP11531 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DmdP11531 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DmdP11531 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DmdP11531 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DmdP11531 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DmdP11531 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DmdP11531 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DmdP11531 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DmdP11531 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DmdP11531 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DmdP11531 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DmdP11531 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DmdP11531 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DmdP11531 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DmdP11531 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DmdP11531 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DmdP11531 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DmdP11531 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DmdP11531 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DmdP11531 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DmdP11531 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DmdP11531 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DmdP11531 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DmdP11531 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DmdP11531 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DmdP11531 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DmdP11531 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DmdP11531 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DmdP11531 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DmdP11531 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DmdP11531 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DmdP11531 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DmdP11531 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DmdP11531 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DmdP11531 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DmdP11531 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DmdP11531 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DmdP11531 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DmdP11531 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DmdP11531 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DmdP11531 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DmdP11531 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DmdP11531 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DmdP11531 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DmdP11531 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DmdP11531 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DmdP11531 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DmdP11531 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DmdP11531 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DmdP11531 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DmdP11531 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DmdP11531 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DmdP11531 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DmdP11531 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DmdP11531 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms