Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Tnp1P10856 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms