Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd8bP10300 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd8bP10300 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms