Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl2P10148 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl2P10148 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms