Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl1P10146 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl1P10146 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms