Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CatspereP0DP43 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CatspereP0DP43 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CatspereP0DP43 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms