Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Khdc1bP0C7A0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Khdc1bP0C7A0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms