Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprqP0C5E4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtprqP0C5E4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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