Protein–RNA interactions for Protein: P0C0A3

Chmp6, Charged multivesicular body protein 6, mousemouse

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp6P0C0A3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp6P0C0A3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp6P0C0A3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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