Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd3P09027 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd3P09027 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms