Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc8P09025 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc8P09025 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms