Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NefmP08553 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NefmP08553 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NefmP08553 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NefmP08553 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NefmP08553 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NefmP08553 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NefmP08553 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NefmP08553 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NefmP08553 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NefmP08553 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NefmP08553 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NefmP08553 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NefmP08553 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NefmP08553 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NefmP08553 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NefmP08553 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NefmP08553 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NefmP08553 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NefmP08553 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NefmP08553 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NefmP08553 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NefmP08553 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NefmP08553 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NefmP08553 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NefmP08553 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NefmP08553 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NefmP08553 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NefmP08553 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NefmP08553 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NefmP08553 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NefmP08553 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NefmP08553 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NefmP08553 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NefmP08553 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NefmP08553 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NefmP08553 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NefmP08553 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NefmP08553 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NefmP08553 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NefmP08553 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NefmP08553 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NefmP08553 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NefmP08553 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NefmP08553 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NefmP08553 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NefmP08553 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NefmP08553 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NefmP08553 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NefmP08553 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NefmP08553 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NefmP08553 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NefmP08553 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NefmP08553 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NefmP08553 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NefmP08553 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NefmP08553 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NefmP08553 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NefmP08553 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NefmP08553 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NefmP08553 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NefmP08553 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NefmP08553 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NefmP08553 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NefmP08553 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NefmP08553 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NefmP08553 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
NefmP08553 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NefmP08553 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NefmP08553 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NefmP08553 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NefmP08553 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NefmP08553 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NefmP08553 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NefmP08553 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NefmP08553 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NefmP08553 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NefmP08553 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NefmP08553 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NefmP08553 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NefmP08553 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NefmP08553 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NefmP08553 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NefmP08553 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NefmP08553 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NefmP08553 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NefmP08553 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NefmP08553 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NefmP08553 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NefmP08553 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NefmP08553 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NefmP08553 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NefmP08553 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NefmP08553 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NefmP08553 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NefmP08553 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NefmP08553 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NefmP08553 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NefmP08553 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NefmP08553 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms