Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06344 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06344 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06344 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06344 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06344 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06344 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06344 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06344 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06344 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06344 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06344 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06344 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06344 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06344 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06344 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06344 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06344 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06344 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06344 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06344 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06344 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P06344 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P06344 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
P06344 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06344 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06344 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P06344 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06344 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06344 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06344 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06344 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P06344 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06344 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06344 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06344 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06344 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06344 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P06344 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06344 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06344 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06344 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06344 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06344 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06344 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06344 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06344 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06344 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06344 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06344 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06344 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06344 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06344 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06344 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06344 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06344 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P06344 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06344 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06344 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06344 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06344 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06344 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06344 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06344 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06344 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06344 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06344 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06344 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06344 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06344 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06344 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06344 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06344 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06344 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06344 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06344 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06344 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06344 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06344 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06344 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P06344 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06344 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06344 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06344 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms