Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06321 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06321 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06321 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06321 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P06321 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P06321 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P06321 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P06321 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P06321 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P06321 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P06321 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06321 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06321 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06321 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06321 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06321 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06321 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06321 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06321 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06321 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P06321 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06321 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06321 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06321 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06321 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06321 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06321 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06321 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06321 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06321 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06321 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06321 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06321 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06321 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06321 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06321 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06321 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06321 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06321 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06321 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06321 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06321 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06321 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06321 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P06321 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06321 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06321 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06321 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06321 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06321 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06321 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06321 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06321 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06321 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06321 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P06321 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06321 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06321 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06321 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06321 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06321 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06321 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P06321 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06321 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
P06321 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
P06321 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06321 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06321 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06321 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06321 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06321 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06321 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06321 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06321 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06321 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06321 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06321 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06321 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06321 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06321 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06321 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06321 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P06321 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06321 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06321 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06321 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06321 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06321 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06321 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06321 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06321 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06321 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06321 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06321 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06321 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06321 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P06321 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06321 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06321 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms