Protein–RNA interactions for Protein: P04918

Saa3, Serum amyloid A-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa3P04918 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa3P04918 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa3P04918 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa3P04918 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa3P04918 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa3P04918 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa3P04918 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa3P04918 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Saa3P04918 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms