Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt10P02535 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt10P02535 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt10P02535 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt10P02535 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt10P02535 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt10P02535 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt10P02535 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt10P02535 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt10P02535 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms