Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-Ab1P01921 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Ab1P01921 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Ab1P01921 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms