Protein–RNA interactions for Protein: P01849

Tcra, T-cell receptor alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcraP01849 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TcraP01849 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TcraP01849 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TcraP01849 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TcraP01849 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TcraP01849 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TcraP01849 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TcraP01849 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TcraP01849 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TcraP01849 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TcraP01849 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TcraP01849 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TcraP01849 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TcraP01849 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TcraP01849 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TcraP01849 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TcraP01849 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TcraP01849 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TcraP01849 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TcraP01849 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TcraP01849 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TcraP01849 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TcraP01849 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TcraP01849 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TcraP01849 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TcraP01849 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TcraP01849 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TcraP01849 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TcraP01849 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TcraP01849 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TcraP01849 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TcraP01849 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TcraP01849 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms