Protein–RNA interactions for Protein: P01812

Ig heavy chain V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01812 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01812 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01812 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01812 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01812 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01812 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01812 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01812 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01812 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01812 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01812 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01812 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01812 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01812 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01812 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01812 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01812 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01812 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01812 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01812 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01812 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01812 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01812 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01812 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01812 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01812 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01812 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01812 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01812 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01812 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01812 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01812 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01812 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01812 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01812 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01812 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01812 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01812 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01812 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01812 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01812 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01812 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01812 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01812 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01812 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01812 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01812 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01812 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01812 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01812 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01812 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01812 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01812 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01812 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01812 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01812 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01812 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01812 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01812 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01812 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01812 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01812 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01812 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01812 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01812 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01812 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01812 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01812 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01812 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01812 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01812 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01812 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01812 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01812 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01812 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01812 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01812 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01812 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01812 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01812 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01812 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01812 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01812 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01812 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01812 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01812 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01812 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01812 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01812 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01812 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01812 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01812 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01812 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01812 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01812 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01812 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01812 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01812 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01812 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01812 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms