Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01808 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01808 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01808 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01808 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01808 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01808 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01808 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01808 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01808 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01808 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01808 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01808 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01808 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01808 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01808 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01808 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01808 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01808 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01808 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01808 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01808 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01808 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01808 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01808 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01808 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01808 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01808 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01808 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01808 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01808 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01808 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01808 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01808 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01808 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01808 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01808 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01808 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01808 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01808 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01808 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01808 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01808 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01808 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01808 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01808 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01808 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01808 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01808 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01808 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01808 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01808 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01808 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01808 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01808 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms