Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01757 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01757 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01757 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01757 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01757 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01757 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01757 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01757 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01757 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01757 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01757 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01757 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01757 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01757 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01757 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01757 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01757 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01757 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01757 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01757 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01757 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01757 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01757 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01757 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01757 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01757 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01757 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01757 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01757 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01757 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01757 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01757 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01757 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01757 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01757 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01757 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01757 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01757 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01757 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01757 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01757 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01757 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01757 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01757 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01757 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01757 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01757 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01757 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01757 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01757 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01757 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01757 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01757 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01757 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01757 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01757 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01757 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01757 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01757 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01757 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01757 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01757 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01757 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P01757 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01757 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01757 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01757 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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