Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01728 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01728 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01728 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01728 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01728 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01728 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01728 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01728 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01728 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01728 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01728 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01728 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01728 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01728 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01728 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01728 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01728 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01728 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01728 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01728 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01728 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01728 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01728 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01728 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01728 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01728 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01728 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01728 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01728 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01728 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01728 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01728 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01728 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01728 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01728 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01728 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01728 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01728 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01728 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01728 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01728 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01728 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01728 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01728 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01728 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01728 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01728 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01728 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01728 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01728 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01728 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01728 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01728 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01728 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01728 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01728 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01728 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01728 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01728 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01728 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01728 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01728 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01728 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01728 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01728 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01728 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01728 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01728 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01728 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01728 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01728 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01728 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01728 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01728 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01728 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01728 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01728 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01728 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01728 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01728 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01728 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01728 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01728 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01728 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms