Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01662 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01662 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01662 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01662 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01662 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01662 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01662 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01662 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01662 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01662 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01662 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01662 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01662 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01662 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01662 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01662 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01662 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01662 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01662 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01662 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01662 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01662 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01662 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01662 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01662 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01662 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01662 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01662 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01662 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01662 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01662 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01662 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01662 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01662 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01662 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01662 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01662 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01662 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01662 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01662 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01662 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01662 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01662 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01662 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01662 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01662 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01662 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01662 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01662 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01662 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01662 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01662 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01662 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01662 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01662 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01662 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01662 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01662 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01662 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01662 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01662 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01662 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01662 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01662 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01662 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01662 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01662 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01662 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01662 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01662 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P01662 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01662 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01662 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01662 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01662 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01662 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01662 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01662 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01662 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01662 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01662 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01662 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01662 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01662 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms