Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01649 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01649 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01649 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01649 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01649 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01649 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01649 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01649 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01649 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01649 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01649 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01649 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01649 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01649 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01649 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01649 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01649 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01649 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01649 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01649 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01649 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01649 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01649 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01649 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01649 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01649 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01649 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01649 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01649 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01649 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01649 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01649 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01649 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01649 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01649 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01649 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01649 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01649 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01649 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01649 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01649 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01649 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01649 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01649 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01649 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01649 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01649 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01649 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01649 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01649 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01649 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01649 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01649 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01649 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01649 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01649 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01649 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01649 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01649 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01649 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01649 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01649 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01649 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01649 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01649 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01649 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01649 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01649 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01649 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01649 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01649 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01649 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01649 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01649 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01649 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01649 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01649 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01649 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01649 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01649 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01649 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01649 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01649 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01649 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
P01649 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01649 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01649 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
P01649 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01649 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01649 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01649 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01649 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01649 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01649 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01649 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01649 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01649 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01649 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01649 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms