Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mtatp6P00848 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms