Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp8O89110 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp8O89110 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp8O89110 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Casp8O89110 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp8O89110 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casp8O89110 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Casp8O89110 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms