Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccl20O89093 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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