Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc6O88978 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc6O88978 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc6O88978 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms