Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Setdb1O88974 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setdb1O88974 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.6 ms