Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MscO88940 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MscO88940 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MscO88940 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MscO88940 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MscO88940 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MscO88940 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MscO88940 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MscO88940 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MscO88940 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MscO88940 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MscO88940 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MscO88940 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MscO88940 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MscO88940 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MscO88940 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MscO88940 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MscO88940 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MscO88940 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MscO88940 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MscO88940 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MscO88940 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MscO88940 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MscO88940 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MscO88940 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MscO88940 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MscO88940 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MscO88940 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MscO88940 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MscO88940 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MscO88940 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MscO88940 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MscO88940 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MscO88940 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MscO88940 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MscO88940 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MscO88940 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MscO88940 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MscO88940 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MscO88940 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MscO88940 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MscO88940 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MscO88940 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MscO88940 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MscO88940 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MscO88940 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MscO88940 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MscO88940 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MscO88940 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MscO88940 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MscO88940 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MscO88940 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MscO88940 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MscO88940 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MscO88940 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MscO88940 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MscO88940 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MscO88940 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MscO88940 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MscO88940 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MscO88940 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MscO88940 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MscO88940 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MscO88940 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MscO88940 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MscO88940 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MscO88940 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MscO88940 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MscO88940 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MscO88940 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MscO88940 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MscO88940 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MscO88940 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MscO88940 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MscO88940 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MscO88940 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MscO88940 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MscO88940 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MscO88940 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MscO88940 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MscO88940 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MscO88940 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MscO88940 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MscO88940 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MscO88940 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MscO88940 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MscO88940 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MscO88940 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MscO88940 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MscO88940 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MscO88940 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms