Protein–RNA interactions for Protein: O88888

Apba3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba3O88888 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba3O88888 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba3O88888 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba3O88888 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apba3O88888 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apba3O88888 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apba3O88888 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba3O88888 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba3O88888 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba3O88888 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms