Protein–RNA interactions for Protein: O88796

Rpp30, Ribonuclease P protein subunit p30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp30O88796 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Rpp30O88796 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rpp30O88796 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rpp30O88796 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rpp30O88796 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rpp30O88796 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rpp30O88796 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rpp30O88796 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpp30O88796 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Rpp30O88796 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rpp30O88796 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rpp30O88796 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rpp30O88796 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rpp30O88796 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpp30O88796 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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