Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BlmO88700 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
BlmO88700 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
BlmO88700 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
BlmO88700 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
BlmO88700 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
BlmO88700 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
BlmO88700 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
BlmO88700 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BlmO88700 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BlmO88700 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BlmO88700 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
BlmO88700 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BlmO88700 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BlmO88700 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BlmO88700 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
BlmO88700 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
BlmO88700 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
BlmO88700 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
BlmO88700 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BlmO88700 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BlmO88700 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BlmO88700 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BlmO88700 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BlmO88700 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BlmO88700 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BlmO88700 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BlmO88700 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BlmO88700 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BlmO88700 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BlmO88700 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BlmO88700 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
BlmO88700 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
BlmO88700 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
BlmO88700 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
BlmO88700 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
BlmO88700 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
BlmO88700 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
BlmO88700 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
BlmO88700 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BlmO88700 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BlmO88700 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
BlmO88700 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BlmO88700 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
BlmO88700 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BlmO88700 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
BlmO88700 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
BlmO88700 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BlmO88700 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BlmO88700 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BlmO88700 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
BlmO88700 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
BlmO88700 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BlmO88700 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BlmO88700 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
BlmO88700 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
BlmO88700 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
BlmO88700 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
BlmO88700 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BlmO88700 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BlmO88700 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BlmO88700 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BlmO88700 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
BlmO88700 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
BlmO88700 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
BlmO88700 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
BlmO88700 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
BlmO88700 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
BlmO88700 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
BlmO88700 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
BlmO88700 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
BlmO88700 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
BlmO88700 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
BlmO88700 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BlmO88700 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
BlmO88700 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BlmO88700 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BlmO88700 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
BlmO88700 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BlmO88700 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BlmO88700 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BlmO88700 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
BlmO88700 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
BlmO88700 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
BlmO88700 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
BlmO88700 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
BlmO88700 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
BlmO88700 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
BlmO88700 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
BlmO88700 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
BlmO88700 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
BlmO88700 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
BlmO88700 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BlmO88700 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BlmO88700 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BlmO88700 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
BlmO88700 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
BlmO88700 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
BlmO88700 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
BlmO88700 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms