Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ComtO88587 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ComtO88587 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ComtO88587 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ComtO88587 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ComtO88587 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ComtO88587 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ComtO88587 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ComtO88587 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ComtO88587 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ComtO88587 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ComtO88587 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ComtO88587 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ComtO88587 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ComtO88587 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ComtO88587 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ComtO88587 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ComtO88587 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ComtO88587 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ComtO88587 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ComtO88587 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ComtO88587 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ComtO88587 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ComtO88587 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ComtO88587 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ComtO88587 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ComtO88587 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ComtO88587 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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ComtO88587 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ComtO88587 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ComtO88587 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ComtO88587 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ComtO88587 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ComtO88587 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ComtO88587 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ComtO88587 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ComtO88587 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ComtO88587 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ComtO88587 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ComtO88587 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ComtO88587 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ComtO88587 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ComtO88587 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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ComtO88587 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ComtO88587 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ComtO88587 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ComtO88587 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ComtO88587 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ComtO88587 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ComtO88587 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ComtO88587 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ComtO88587 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ComtO88587 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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ComtO88587 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ComtO88587 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ComtO88587 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ComtO88587 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ComtO88587 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ComtO88587 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ComtO88587 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ComtO88587 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ComtO88587 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ComtO88587 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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ComtO88587 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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ComtO88587 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ComtO88587 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ComtO88587 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ComtO88587 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ComtO88587 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ComtO88587 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ComtO88587 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ComtO88587 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ComtO88587 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ComtO88587 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ComtO88587 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ComtO88587 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ComtO88587 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ComtO88587 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ComtO88587 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ComtO88587 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ComtO88587 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ComtO88587 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ComtO88587 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ComtO88587 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ComtO88587 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ComtO88587 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ComtO88587 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ComtO88587 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ComtO88587 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ComtO88587 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ComtO88587 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ComtO88587 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ComtO88587 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ComtO88587 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms