Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap30O88574 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sap30O88574 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap30O88574 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap30O88574 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms