Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tnnt1O88346 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnnt1O88346 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnnt1O88346 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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