Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Nid2O88322 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nid2O88322 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nid2O88322 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nid2O88322 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nid2O88322 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nid2O88322 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nid2O88322 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nid2O88322 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nid2O88322 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nid2O88322 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nid2O88322 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Nid2O88322 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nid2O88322 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nid2O88322 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms