Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfdp1O88271 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfdp1O88271 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfdp1O88271 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms