Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec11aO88200 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec11aO88200 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms